بیوانفورماتیک سرطان

کتاب بیوانفورماتیک سرطان، نوشته الگزاندر کراسنیتز: ترجمه دکتر چنگیز اصلاحچی، محمد محمودی‌گماری، ادریس چوپانی، الهام دیده‌ورا، زهرا محمودی، مهین عموپور، یگانه شجاعی، انتشارات دانشگاه شهید بهشتی

کتاب پیش رو طیف گسترده ای از روشها و ابزارهای مرتبط با سرطان را برای تجزیه و تحلیل و تفسیر داده ها پوشش میدهد که نشان دهنده وضعیت رو به پیشرفت کاربرد انفورماتیک داده در حوزه سرطان است. این کتاب برای طیف وسیعی از پژوهشگران از جمله محققان فعال در زیست شناسی محاسباتی پژوهشگران حوزه بیوانفورماتیک انکولوژیست های که برای مطالعات خود به روشهای بیوانفورماتیکی نیاز دارند و فعالان حوزه طراحی و توسعه داروهای ضد سرطان که به هدفمند کردن تحقیقات خود تمایل دارند. می تواند مفید باشد.

فهرست مطالب :

فصل اول : مقدمه ای بر دسترسی به مخازن بزرگ داده های ژنومیکس مرتبط سرطان
فصل دوم : جریان کاری پرتابل و تکرار پذیر انفورماتیک سرطان: مطالعه موردی توالی یابی RNA‏
فصل سوم : تجزیه و تحلیل محاسباتی واریانت های ساختاری موجود در ژنوم سرطان
فصل چهارم : CORE: ابزاری نرم افزاری برای تعبیر تعیین نواحی تغییر شماره کپی DNA پرتکرار در سرطان
فصل پنجم : شناسایی جهش اونکوژن ها در نمونه های (RNA-Seq (Unpaired
فصل ششم : یک پروتکل محاسباتی برای شناسایی جهش های سوماتیکی از طریق ادغام توالی یابی DNA و RNA
فصل هفتم : تحلیل بیان گوناگون آللهای ژنی در سرطان با استفاده از NGS
فصل هشتم : تحلیل محاسباتی عملکرد IncRNA در سرطان
فصل نهم : روش های محاسباتی شناسایی نئواپی توپ های سلول T در تومورها
فصل دهم : تحلیل محاسباتی و آماری داده های های متیلاسیون DNA مبتنی بر آرایه
فصل یازدهم : روش های محاسباتی برای دسته بندی زیر گروهای توموری و کاربرد آنها در رمزگشایی از ناهمگونی گونی تومور
فصل دوازدهم : شناسایی آماری دسته های فرعی تومورها
فصل سیزدهم : روش های محاسباتی برای تحلیل همسانگی و تاریخچه تکاملی
فصل چهاردهم : مدل سازی سازی پیش بینی حساسیت به داروهای ضد سرطانی بر اساس خصوصیات ژنتیکی
فصل پانزدهم : کاربرد in silico در تغییر کاربری و پلی فارماکولوژی داروهای سرطانی
فصل شانزدهم : مدل سازی رشد تومورها و رفتارشناسی تهاجم آنها با استفاده از ه از توابع ریاضیاتی